Исследователи из Института штата Огайо сделали 1-ый каталог вирусных популяций, обитающих в кишечном тракте человека. Исследование, получившее заглавие «База данных пищеварительных виромов», подразумевает, что вирусная популяция кишечного тракта всякого человека так же неповторима, как и их отпечатки пальцев.
Микробиом кишечного тракта стал главным объектом исследовательских работ за крайние пару лет опосля того, как было найдено, что триллионы микробов, живущих в нашей пищеварительной системе, играют главную роль в поддержании здоровья человека.
Подавляющее большая часть этих организмов в нашем кишечном тракте – это бактерии, но микробиом кишечного тракта – это не попросту мощная бактериальная популяция – он также состоит из паразитов, грибов и вирусов.
Составить каталог этих остальных жителей микробиома тяжело. У вирусов, в отличие от микробов, отсутствуют всепригодные геномные маркеры.
Практически, от 40 до 90 процентов вирусных геномных последовательностей известны как «вирусная черная материя», что значит, что они не совпадают с какими-либо известными эталонными вирусными последовательностями.
Потому первым шагом исследователей было собрать данные из 10-ов прошлых исследовательских работ вирусов в кишечном тракте человека. Окончательный набор данных обхватывал практически 2000 человек из 16 государств.
«Мы употребляли машинное обучение (педагогический процесс, в результате которого учащиеся под руководством учителя овладевают знаниями, умениями и навыками) на узнаваемых вирусах, чтоб посодействовать нам идентифицировать неведомые вирусы», – разъясняет создатель Энн Грегори. «Нас заинтересовывало, сколько типов вирусов мы можем созидать в кишечном тракте, и мы обусловили это по тому, сколько типов геномов мы могли созидать, так как мы не могли созидать вирусы зрительно».
В итоге исследования было каталогизировано 33 242 неповторимых вирусных популяции, и был сотворен новейший справочный ресурс с открытым начальным кодом под заглавием “База данных пищеварительных виромов”.
Смотрите такжеМедицина
Исследование показывает новейший перспективный продукт от астмы
24.08.2020Вирусология
Геномный анализ указывает, какие виды звериных могут быть уязвимы к инфекции (Термин означает различные виды взаимодействия чужеродных микроорганизмов с организмом человека) SARS-CoV-2
22.08.2020
Чтоб установить эффективность новейшей базы данных, исследователи находили закономерности в данных. Сначало они нашли, что обилие вирома (так именуется совокупа вирусов) в кишечном тракте возрастает с годами, но, кажется, миниатюризируется опосля 65 лет.
Эта модель припоминает возрастные модели контраста, наблюдаемые в популяциях пищеварительных микробов, но одно было найдено приметное исключение. В кишечном тракте малышей с дисфункциональной иммунной системой наблюдается приметное вирусное обилие, но ограниченное бактериальное обилие.
«Общее практическое правило экологии заключается в том, что большее обилие ведет к наиболее здоровой экосистеме», – гласит Грегори. «Мы знаем, что большее обилие вирусов и бактерий обычно соединено с наиболее здоровым человеком. И мы узрели, что наиболее здоровые люди, обычно, имеют большее обилие вирусов, что показывает на то, что эти вирусы могут потенциально созодать что-то положительное и иметь полезную роль».
Очередное увлекательное открытие новейшего исследования – подавляющее большая часть занесенных в каталог вирусов были фагами. Также известные как бактериофаги, это очень всераспространенные вирусы, которые прикрепляются к микробам и плодятся снутри их.
Мэтью Салливан, старший создатель исследования, подразумевает, что существует собственного рода симбиотическая связь меж фагами и микробами в микробиоме кишечного тракта, и гласит, что новенькая база данных виромов кишечного тракта станет принципиальным инвентарем для хоть какого исследователя, планирующего терапевтическое исцеление, основанное на модуляции микробиома кишечного тракта.
«Фаги являются частью широкой взаимосвязанной сети организмов, которые живут с нами и в нас, и когда лекарства широкого диапазона деяния употребляются для борьбы с заразой, они также наносят вред нашему естественному микробиому», – разъясняет Салливан. «Мы создаем инструментарий для расширения нашего осознания и способностей использования фагов для опции нарушенных микробиомов назад в здоровое состояние».
Исследование добавляет очередной непростой слой к микробиому кишечного тракта. Непонятно, как эти вирусы могут влиять на общее состояние здоровья людей, но ученые отмечают, что это исследование указывает, что главный группы вирусов, общих для кишечного тракта всех людей, не существует.
Практически, обилие пищеварительного вирома таково, что персональная вирусная популяция всякого человека быть может таковой же неповторимой, как и их отпечатки пальцев. Ученые молвят, что новенькая база данных – 1-ый шаг к выяснению того, вызывают ли пищеварительные вирусы заболевания человека либо они просто находятся под воздействием заболевания.
Новое исследование было размещено в журнальчике Cell Host & Microbe.
Источник: